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中國完整破譯小麥“生命天書” 給“糧倉支柱”裝上基因導航

原標題:中國完整破譯小麥“生命天書”,給“糧倉支柱”裝上基因導航

全球首個六倍體小麥端粒到端粒(T2T)完整基因組圖譜在山東繪就

中國完整破譯小麥“生命天書”

◆給“糧倉支柱”裝上基因導航 ◆為新品種培育按下加速鍵

如果把小麥的基因組比作一本由145億個字符寫成的“生命天書”,過去的科學家只能看到并讀懂其中零散的章節(jié),而如今,這本“天書”第一次被從頭到尾完整破譯。

4月7日,來自濰坊現代農業(yè)山東省實驗室(北京大學現代農業(yè)研究院)的科研團隊在國際頂級學術期刊《自然·遺傳學》發(fā)布全球首個六倍體小麥端粒到端粒(T2T)完整基因組圖譜,完成對小麥全部21對染色體頭尾無缺口精準拼接,標志著人類對小麥這一“糧倉支柱”的認知邁入無盲區(qū)時代。這項被比喻為“給小麥裝上基因導航”的突破,將為高產、抗病、耐旱、耐鹽的新品種培育按下加速鍵。

登頂“植物界珠峰”

作為最古老的糧食作物之一,小麥的基因組堪稱“植物界的珠穆朗瑪峰”,它的遺傳密碼總長達14.51Gb,含145億個堿基,是水稻的40倍、人類的5倍,更擁有三套既高度同源又有明顯分化的亞基因組,如同三套被撕碎后混成一堆的百科全書。尤其讓科學家頭疼的是,基因組中近85%是重復序列,就像把同一段文字復印了成千上萬次后胡亂拼貼,傳統(tǒng)測序技術如同拿著模糊的放大鏡,始終無法看清全貌。

“過去我們只能通過零碎的基因組片段推測小麥的生命邏輯,現在終于有了完整清晰的圖譜。”濰坊現代農業(yè)山東省實驗室(北京大學現代農業(yè)研究院)主任鄧興旺說。

為了把這本小麥“生命天書”拼接完整,鄧興旺組建了一支21人的跨學科團隊,集合了測序技術專家、生物信息學家和育種專家,歷經兩年多艱苦攻關,終于在2023年8月繪制出完整圖譜,實現“珠峰登頂”。

基因組測序是解析生命密碼的關鍵技術。在繪制圖譜過程中,科研團隊創(chuàng)造性地融合兩種前沿測序技術:PacBio HiFi測序技術如同超高精度顯微鏡,能夠精準讀取2萬個堿基長度的DNA片段;ONT超長測序技術則如同全景廣角相機,單次測序長度可突破20萬個堿基。為突破數據運算瓶頸,山東省政府專項支持擴容升級超級計算機中心,為基因組組裝提供了強大的算力保障。

為小麥編寫“免疫程序”

濰坊現代農業(yè)山東省實驗室(北京大學現代農業(yè)研究院)研究員陳時盛長期致力于小麥抗病遺傳育種實驗,借助全新基因組圖譜,他的團隊剛完成一個抗病基因的定位克隆。“在以前版本的參考基因組圖中,有些基因所在的染色體區(qū)域存在組裝錯誤,一度使課題研究迷失方向、陷入僵局。”陳時盛形象地比喻,“這份圖譜為小麥遺傳研究裝上了完整版的導航系統(tǒng),我們可以精準定位基因在染色體上的坐標,快速鎖定候選基因,顯著縮短研究周期。”

最復雜的難題往往藏著最珍貴的寶藏。“有了完整基因圖譜,我們第一次能精準定位控制抗病、高產等性狀的‘開關’。”論文共同作者何航研究員展示了3.4萬個過去未被發(fā)現的高置信度基因。例如,一批NLR抗病基因的識別,讓科學家能像編寫“免疫程序”般設計抗病的小麥。

這項研究成果還帶來了一系列顛覆性的科學發(fā)現:小麥從四倍體升級為六倍體時,基因組發(fā)生過23次“乾坤大挪移”,總計5.18億堿基的染色體倒位,暗示著小麥祖先在進化中不斷“試錯重組”,最終篩選出最優(yōu)版本;占基因組大頭的重復序列也并非“垃圾文件”,其中隱藏著小麥進化的“生存智慧”,海量的遺傳變異素材使其能夠在氣候變化和病蟲害威脅中“見招拆招”。

給種子裝上“中國芯”

作為全球最重要的糧食作物,小麥年產量已接近8億噸,養(yǎng)活了全球35%以上的人口。隨著中國科研團隊將完整基因組數據向全球開放共享,人類在馴化小麥一萬年后,終于真正讀懂了這位“老朋友”的生命密碼。

這項成果也被視為應對糧食危機的“科技盾牌”。隨著全球氣候變化加劇,極端干旱、高溫和新型病原體頻發(fā),小麥主產區(qū)的穩(wěn)產壓力陡增。“完整基因組就像一套‘應急預案庫’,我們可以快速找到讓小麥耐旱、耐鹽的基因組合,設計出適應更惡劣環(huán)境的‘未來小麥’。”鄧興旺告訴記者,通過掌握雜交小麥技術制高點,團隊正在培育兼具抗病、高產、優(yōu)質特性的突破性新品種,目前已開發(fā)出20余項核心專利技術。

正如鄧興旺所言:“讀懂小麥的基因組,就握緊了糧食安全的命脈。”這場已持續(xù)數十年的“基因解碼戰(zhàn)”,不僅讓中國在國際農業(yè)科技競爭中搶占先機,更讓“中國飯碗”裝“中國糧”的底氣更足。(大眾新聞記者 王佳聲 張蓓)

[來源:大眾日報 編輯:李源菁]
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2025 04/11 15:56
· 來源 ·
大眾日報
· 責編 ·
李源菁
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